1、分布区域不同
（1）壁虎：主要产于我国西南及长江流域以南诸地区；也分布到日本。
（2）四脚蛇：主要分布在我国福建、广东、广西、江苏、浙江等地区。
2、形态特征不同
（1）壁虎：壁虎吻斜扁，吻长约为眼径的2倍;吻鳞长方形，上缘与一对较大的鼻间鳞及其中间一片小形鳞片相联；鼻孔圆形，位于吻端，上唇鳞9~11片，由前往后逐渐变小;颏鳞五角形，前宽后窄;后颏鳞3对，外侧一对最小;耳孔小，卵圆形，内陷体背自额、顶、颞、枕部至尾基被以粒鳞。
（2）四脚蛇：全体披有鳞片。吻钝圆，吻长为眼径的1.5倍；鼻孔在鼻鳞的中央；鼻鳞、吻鳞；头部鳞大小不等，均具棱；有鼓膜，鼓膜处覆有小鳞；眼睑发达，能动，瞳孔圆形。背鳞及体侧的鳞较小；背中央有鬣鳞，愈向后愈小，至尾部消失；其两外侧各有1行棱鳞。
3、科目不同
（1）壁虎：壁虎属于蜥蜴目壁虎科。
（2）四脚蛇：四脚蛇属于有鳞目蜥蜴科。
